این بخش تحقیقاتی در سال 1393از ادغام دو بخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر و بخش تحقیقات باغبانی تشکیل و با عنوان بخش تحقیقات علوم زراعی و باغی فعالیت خود ادامه داد.
این بخش در حال حاضر به عنوان نماینده دو موسسه تحقیقاتی کشور شامل موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر و موسسه تحقیقات علوم باغبانی فعالیت می کند.
رئیس بخش تحقیقات مسئول پیگیری و هماهنگی با مدیریت مرکز و سایر بخش های تحقیقاتی در مرکز و موسسات مادری، سازمان تحقیات از یک طرف و بخش اجرا (سازمان کشاورزی و مدیریت های تابعه) و بخش خصوصی از طرف دیگر در جهت تحقق اهداف و وظایف محوله بخش می باشد.
شرح وظایف و اهداف بخش تحقیقات علوم زراعی و باغی
این بخش با انجام پژوهش های مختلف به زراعی و به نژادی بر روی محصولات مختلف زراعی و باغی متناسب با شرایط اقلیمی استان و بر اساس اساس سياستهاي وزارت كشاورزي و اولویت های تحقیقات ملی و استانی سعی در برطرف نمودن مشکلات و تنگناهای تولیدات زراعی و باغی استان و با هدف افزایش تولید و بهبود عملكرد کمی و کیفی در واحد سطح و توسعه کشاورزی استان متناسب با اهداف و برنامه‌‌ریزی‌های وزارت جهاد کشاورزی، سازمان تحقیقات و موسسات مادری و سازمان‌های ذیربط به فعالیت‌های تحقیقاتی خود ادامه می‌دهد.
مهمترین وظایف بخش تحقیقات علوم زراعی و باغی
انجام طرح‌های تحقیقاتی (ملی، مستقل، خاص و مشترک)، تحقیقی-تطبیقی، تحقیقی-ترویجی،
انجام تحقيقات لازم برای رفع نیازهای بخش اجرا (سازمان کشاورزی و مدیریت های تابعه) و بخش خصوصی،
همکاری با بخش‌های اجرایی سازمان جهاد کشاورزی و مدیریت های تابعه،
طراحی و برگزاری و تدریس کارگاه ها و دوره‌های آموزشی و پژوهشی،
آموزش بهره برداران و کارشناسان و مروجان در قالب اجرای دوره ها و کارگاه‌های آموزشی،
انتقال یافته ها،
انجام فعالیت های صحرایی و بازدید های میدانی و کارشناسی در قالب کمیته های تخصصی،سایت های الگویی،
محققین معین،یاوران تولید وروزمزرعه و ارائه توصیه‌های فنی به کشاورزان و باغداران ،
تدوين نشریات ترویجی و فني، دستورالعمل های فنی براي نحوه كاشت، داشت و برداشت گياهان باغی و زراعی متناسب با شرایط اقلیمی استان،
توسعه تحقیقات برای استفاده از روش‌های نوین و کاربرد فناوری‌های نوین،
ارائه مقالات علمی (در همایش‌ها، کنگره‌های ملی و بین‌المللی و مجلات علمی پژوهشی داخلی و خارجی)،
کمک به تجاری سازی یافته‌ها و درآمدزایی،
همکاری با دانشگاه‌های کشور در خصوص اجرای پایان نامه‌های دانشجویی(مقاطع کارشناسی ارشد و دکتری)،
ارتباط با سایر مراکز تحقیقاتی و دانشگاهی کشور در جهت پيشبرد برنامه‌هاي تحقیقاتی،
داوری مقالات و پایان نامه ها، آموزش دانشجویان در قالب کارآموزی،
پیگیری و کمک به تجاری سازی یافته‌ها و درامدزایی بخش به منظور تامین منابع مالی در جهت انجام امور جاری و تحقیقاتی