مهمترین ماموریت های بخش تحقیقات خاک و آب 
•    تعیین حدود بحرانی عناصر غذائی در خاک‌های استان
•    تعیین برنامه ارتقای بهره¬وری آب محصولات کشاورزی و باغی استان
•    تهیه نقشه¬های اقلیمی و تناسب اراضی محصولات باغی آبی و دیم استان
•    افزایش بهره¬وری آب برای محصول سیب زمینی با استفاده از روش آبیاری قطره¬ای نواری، ارقام مناسب و شیوه کم آبیاری خشکی موضعی ریشه
•    نوع، ميزان و روش مناسب مصرف كودهاي شيميايي
•    تعیین کارائی جذب عناصر در محصولات مختلف زراعي و باغي
•    بروز رسانی آب مورد نياز گياهان زراعی استان
•    کاربرد دانش هسته‌ای در تحقیقات حاصلخیزی خاک و تغذيه گياهي
•    طبقه‌بندی و تعیین تناسب اراضی برای محصولات مختلف زراعی و باغی با استفاده از شبکه عصبی مصنوعی
•    مطالعات خصوصیات فیزیکی و شیمیائی خاک با استفاده از داده‌های ماهواره‌ای
•    برآورد سطح زیر کشت محصولات مختلف
•    تعيين مقاومت گياهان به خشكي و تعيين مراحل حساس رشد گياه به تنش خشكي
•    افزايش راندمان مصرف آب و كود با تعیین نیاز آب و کود محصولات مهم کشاورزی استان
•    تعيين آلاينده‌هاي موجود در ضايعات شهري و كشاورزي
•    پایش کیفیت خاک
•    معرفی و کاربرد کودهای زیستی
•    مدل‌سازی و تعیین روابط آب و کود
•    معرفی و مصرف قارچ میکوریزی در تولید پایه‌های بادام

مهمترین ماموریت های بخش تحقیقات آبخیزداری 
•    پيشنهاد روشي جديد در بررسي¬هاي ژئوتكنيك زمين¬لغزش¬ها كه باعث بالا بردن دقت كار و صرفه جويي به ميزان 40 % در هزينه¬هاي مطالعاتي مي¬گردد.
•    تعيين، تعريف و اولويت بندي سه روش مناسب شامل روش¬هاي آنبالاگان، نيلسن و مورا وارسون براي پهنه¬بندي خطر زمين لغزش در مناطق كوهستاني زاگرس مرتفع.
•    شناخت مهمترين عوامل موثر در تشكيل آبكند در استان ( افزايش ضريب جريان، از بين رفتن پوشش گياهي، دام مازاد بر ظرفيت، تغيير كاربري، جاده سازي)
•    ارائه سه مدل تجربی برآورد دبی پیک سیلاب و شبکه عصبی ویژه استان چهارمحال و بختیاری
•    تعیین وسعت دقیق سازندهای مارنی استان چهارمحال وبختیاری همراه با طبقه¬بندی مارن¬های فرسایش¬پذیر براساس خصوصیات فیزیکی شیمیایی وکانی¬شناسی آن¬ها و تعیین شاخص¬های فرسایش پذیری مارن¬ها
•    تعیین امکان ایجاد آلودگی¬های ژئوشیمیایی درسرزمین¬های آذرین دراثرپدیده¬های هوازدگی ودگرسانی و ردیابی آن¬ها با استفاده از عناصر نادر و فلزات سنگین
•    تعيين فرمول¬هاي جديدي براي ذوب برف
•    ایجاد ایستگاه برف¬سنجی و اندازه¬گیری ویژگی¬های مربوط به ذوب برف در سرشاخه¬های رودخانه کارون باهدف تعیین فرمول¬های ذوب برف
•    ارائه مدل مديريت جامع خطر و خسارت زمين¬لغزش در حوضه آبخيز دوآب صمصامي استان چهارمحال و بختياري
•    تعیین نقش ویژگی¬های فیزیکی و شیمیایی خاک به عنوان عوامل زمینه¬ساز در وقوع زمین¬لغزش (مطالعه موردی: منطقه افسرآبادچهارمحال و بختیاری)
•    پیشنهاد راهکارهای مناسب برای پايدارسازی کناره رودخانه با استفاده از روش بیولوژيک
•    تهیه شناسنامه حوزه¬هاي آبخیز چهارمحال و بختیاری
•    احداث پایلوت سامانه¬های سطوح آبگیر جهت افزایش تولیدات گیاهی به روش دیم در اراضی شیب¬دار
•    شناسايي مهمترین عوامل مؤثر بر ميزان مشاركت آبخيزنشينان در فعاليت‌هاي آبخيزداري
•    شناسایی گونه¬های مرتعي مناسب جهت تثبيت و كنترل فرسايش در اراضي مارني بعنوان اولين دستاورد پژوهشي در حوزه بكارگيري روش هاي بيولوژيكي كنترل فرسايش ورسوب مارنها
•    دستيابي به يك سيستم پشتيباني تصميم گيري (DSS) جهت مكانيابي سدهاي زيرزميني
•    احداث اولين سامانه متمركز جمع آوري آب باران و آغاز پروژه تحقيقاتي درزمينه كشت ارقام بادام با استفاده از اين سامانه در شهرستان بن
•    آغاز اولين پروژه¬ پايش بند زيرزميني در كشور بر روي بند زيرزميني يان¬چشمه
•    تهيه نقشه¬هاي خطر و ريسك حركات توده¬اي استان با استفاده از هوش مصنوعي براي اولين بار

مهمترین ماموریت های بخش تحقیقات جنگل و مرتع 
•    چاپ کتاب فلور استان چهارمحال و بختیاری تشکیل جامع ترین هرباریوم گیاهی استان
•    انتشار کتاب الکترونیک گیاهان تالابی استان چهارمحال و بختیاری
•    انتشار کتاب معرفی گیاهان دارویی مهم و اقتصادی در استان چهارمحال و بختیاری
•    تهیه نقشه پراکنش موسیر در دنیا، ایران و استان چهارمحال و بختیاری
•    تهیه نقشه تناسب اراضی استان چهارمحال و بختیاری برای کشت گیاهان دارویی گل محمدی، موسیر، آویشن دنایی، آنغوزه، باریجه و کلوس 
•    دستیابی به سه نشانگر DNA برای جداسازی ژنوتیپ های مقاوم به خشکیدگی بلوط ایرانی
•     معرفی اکسشن¬ برتر گل¬محمدی با هدف کشت دیم 
•    معرفی کلن¬های برتر صنوبر به منظور تولید چوب و اصلاح کیفی بیشه¬های صنوبر در استان چهارمحال و بختیاری 
•    معرفی اکسشن برتر گونه خارمریم Silybum marianum با هدف تولید بذر
•    معرفی گونه هیبرید populus alba× populus euphratica جهت کشت در صنوبرکاری¬های استان چهارمحال و بختیاری
•    معرفی پارازیتوئید ملخ بادمجانی به منظور مبارزه طبیعی با این آفت در مراتع استان چهارمحال و بختیاری
•    شناسایی دو آفت جدید بر روی صنوبر در ایران و جهان.
•     معرفی دو نوع بذرخوار جدید گیاهان مرتعی برای کشور. 
•     شناسائی آفات و بیماری¬های آویشن 
•    تعیین بهترین روش کاشت گونهAstragalus (Caprini) angustiflorus  در مراتع استان چهارمحال و بختیاری
•    تعیین معادلات آلومتری برآورد بیوماس و اندوخته کربن بلوط ایرانی
•    معرفی مقاومترین بادام وحشی به شوری و خشکی. 

مهمترین ماموریت های بخش تحقیقات گیاه پزشکی 
•    دستیابی به برنامه تلفیقی مدیریت کنترل گل جالیز در باغ¬های بادام استان
•    شناسایی گون¬های علف هرز شایع استان در مزارع و باغات
•    معرفی ترکیبات علف¬کش دارای کارایی مناسب برای کنترل علف¬های هرز مزارع و باغات
•    مطالعه بیولوژی و دستیابی به روش¬های مناسب کنترل بیماری لکه آجری بادام و ارزیابی مقاومت ارقام رایج به این بیماری
•    شناسایی باکتری¬های عامل بیماری لکه نواری باکتریایی گندم و دستیابی به روش مناسب کنترل بیماری
•    شناسایی استرین¬های ویروس کوتولگی زرد جو در مزارع گندم و جو، شناسایی ناقلین، دستیابی به تاریخ کاشت مناسب در مناطق مختلف استان برای کاهش میزان انتقال بیماری، دستیابی به روش مناسب تیمار بذر با حشره-کش¬ها برای کنترل ناقلین و مدیریت تلفیقی بیماری¬های ویروسی گندم و جو
•    مطالعه عوامل باکتریایی بیماری شانکر درختان میوه، شناسایی گونه¬های مهم و غالب، شناسایی مقاومت به سموم مسی در جمعیت ¬های باکتری، دستیابی به فرمولاسیون مناسب ترکیبی برای غلبه بر مقاومت باکتری عامل و کنترل شیمیایی با کارایی مناسب بیماری
•    شناسایی ماهیت عارضه شبه جارویی بادام و دستیابی و معرفی روش مناسب کنترل و مدیریت بیماری
•    شناسایی ویروس¬های مهم در لوبیا و دستیابی به لاین های مقاوم و متحمل به بیماری با انتخاب در بین توده محلی لوبیا 
•    شناسایی عوامل ویروسی و فیتوپلاسمایی عامل سرارغوانی، زردی، زوال و دژنره شدن سیب زمینی و ارایه روش مناسب مدیریت و کنترل بیماری
•    شناسایی ناقل ویروس کوتولگی پیسه ای بادمجان EMDV در مزارع سیب¬زمینی برای اولین بار در دنیا
•    شناسایی قارچ¬های مولد پوسیدگی ریشه و مرگ آوندی بادام و سایر درختان میوه هسته¬دار و ارزیابی مقاومت پایه¬ها و ارقام به این بیماری¬ها و دستیابی و ارایه روش مدیریت این بیماری¬ها 
•    شناسایی گونه¬های زنبور مغزخوار بادام، مطالعه زیست¬شناسی آفت، ارزیابی مقاومت ارقام بادام به بیماری، شناسایی زمان مناسب مبارزه با آفت، ارزیابی کارایی سموم مناسب برای کنترل آفت و ارایه روش مدیریت تلفیقی مبارزه با آفت، دستیابی به ژنوتیپ مامایی مقاوم به زنبور مغز خوار بادام
•    شناسایی گونه¬ها و جمعیت¬های سن گندم، زیست شناسی آفت، شناسایی دشمنان طبیعی، شناسایی عوامل کنترل بیولوژیک و بررسی کارایی و فرمولاسیون قارچ Metarhizium anisopliae روی پوره سن 2 و حشره بالغ سن گندم کارایی مناسب ، روش¬های زراعی و مکانیکی کنترل آفت ، شناسایی مناطق زمستان گذران آفت و ارایه روش مدیریت تلفیقی مناسب برای کنترل آفت
•    مطالعه جمعیت¬های کنه تارتن لوبیا، دستیابی به روش های مناسب کنترل شیمیایی و بیولوژیک برای کنترل آفت و دستیابی به لاین¬های مقاوم به کنه تارتن در لوبیا و تعیین زمان مناسب سمپاشی علیه کنه تارتن لوبیا و کاهش دفعات سم پاشی از 5 بار به دوبار و کاهش قابل ملاحظه مصرف سموم، کاهش آلودگی های زیست محیطی، حفظ دشمنان طبیعی آفت، کاهش باقیمانده سموم بر محصول و جلوگیری از ایجاد نژادهای مقاوم در جمعیت آفت
•    شناسایی، مطالعه دینامیسم جمعیت، معرفی گونه جدید برای اولین¬بار در دنیا روی بادام و ارایه راه¬حل غیرشیمیایی کنترل کنه تارتن بادام و کاهش میزان مصرف سم
•    مطالعه بیولوژی آفت کرم خراط گردو در باغ¬های استان، شناسایی زمان مناسب مبارزه و ارایه برنامه مدیریت تلفیقی کرم خراط در باغ های گردو با محوریت روش¬های غیرشیمیایی (تله های فرمونی)
•    بررسی زیست¬شناسی و دلایل طغیان آفت زنجره بادام در باغات استان، ارزیابی خسارت آفت در مناطق مختلف، و تاثیر عوامل مهم در طغیان آفت 
•    تعیین دقیق چرخه زندگی آفت سرشاخه خوار هلو (Anarsia lineate)، ارایه برنامه مدیریت تلفیقی آفت بر پایه استفاده از تله¬های فرمونی (اخلال در جفت یابی)، هرس به موقع سرشاخه¬های آلوده، زمان مناسب سم¬پاشی و حفاظت و حمایت از زنبور پارازیتوئید Paralitomastix varicornis Nees
•    توصیف و نام¬گذاری یک گونه جدید کنه خاکزی از جنس Gaeolalaps برای دنیا 
 

مهمترین ماموریت بخش تحقیقات علوم دامی 
•    کاهش چربی لاشه بر اثر انتخاب ژنتیکی
•    بهبود کیفیت چربی لاشه با انتخاب ژنتیکی
•    افزایش بازده بره‌دهی در میش‌های لری بختیاری 
•    تعیین احتیاجات مواد مغذی بره‌های در حال رشد
•    تعیین وضعیت و عملکرد گله¬های روستایی و عشایری
•    تعیین فرصت¬های اقتصادی در گاوداری های خرده پا
•    ایجاد رشد جبرانی در بره¬ها پس از محدودیت تغذیه¬ای
•    استفاده از آب پنیر و ملاس برای تهیه پروتئین تک¬یاخته‌ای
•    کاربرد گیاهان داروئی و ویتامینِ ای بر کیفیت گوشت بزغاله¬ها
•    افزایش وزن بره¬های پرواری با استفاده از خوراک بلوک شده 
•    شناسایی بسیاری از خصوصیات فنوتیپی و ژنتیکی گوسفندان نژاد لری بختیاری
•    تعیین شاخص انتخاب برای بهبود رشد و ترکیب لاشه در گوسفندان لری بختیاری 
•    تعیین تابع توزیع زنده مانی و عوامل موثر بر آن در بره ها و میش¬های لری بختیاری 
•    بررسی اثر مدت زمان دوره شیرخوارگی بر رشد و خصوصیات لاشه بره‌های لری بختیاری 
•    بهره‌گیری از ضایعات زراعی، باغی و کارخانجات برای تغذیه دام و تولید پروتئین حیوانی 
 

مهمترین ماموریت های بخش تحقیقات زراعی و باغی
الف محصولات باغی:
•    معرفي رقم گرده¬زا براي ارقام مامايي، ربيع و سفيد و تعيين نحوه گرده¬افشاني آنها
•    معرفي خصوصيات ارقام بادام محلي
•    مطالعه ريزش گل¬هاي ماده گردو و مشخص شدن اثر فزوني گرده آن
•    تعیین و معرفی ارقام جدید زراعی و باغی سازگار با شرایط استان
•    شناسايي و معرفی ژنوتیپ¬های مرغوب و نخبه گردوي استان در جهت تولید گردوی پیوندی و اصلاح باغات گردو 
•    ارزیابی سازگاری، گزینش و معرفی ارقام دیرگل بادام با هدف مقابله با سرمازدگی معرفی ارقام دیرگل ارقام ديرگل شاهرود 6، 12،8،7، 13 و ارقام خودسازگار و دیرگل تونو و سوپرنوا در استان
•    انجام تلاقی¬های کنترل شده ودستیابی به ارقام دیرگل، پربار وخودسازگار بادام از طریق دورگ¬گیری ارقام بادام محلی با ارقام بادام خارجی
•    تعیین خصوصيات كمي و كيفي ارقام بادام محلی و تجاری بادام و معرفی ارقام مناسب استان
•    معرفی ارقام دیرگل و پرمحصول بادام مناسب کشت در استان
•    شناسایی آلل های خودناسازگاری در ارقام بادام ایرانی به روش مولکولی و تعيين بهترين ترکيب های کشت ارقام تجاری بادام درشرایط باغ با توجه به پتانسل تولید، سازگاری گرده افشانی، همزماني و همپوشاني مناسب گلدهي
•    بررسي و مشخص نمودن علل خشکيدگي درختان و بررسی و تعیین علل ریزش گل و میوه بادام در باغات استان
•    بررسی خصوصیات کمی و کیفی مغز در ارقام بادام در استان
•    بهینه سازی تکثیر ارقام و پایه های مختلف بادام از طریق کشت بافت و ریز ازدیادی درون شیشه¬ای
•    سالم¬سازي و تولید هسته‌های اولیه و پایه های مادری سالم ارقام برتر بادام به منظور تولید نهال سالم و گواهی شده 
•    بررسي سازگاری و مقايسه عملکرد 65 رقم و ژنوتیپ های امید بخش دیرگل جدید داخلی بادام به منظور انتخاب ارقام تجاری و پرمحصول مناسب استان
•    توصیه اصلاح باغات درجه دو با اجرای برنامه سرشاخه کاری با ارقام دیرگل
•    ثبت ارقام بومی بادام از طریق نشانگر های مورفولوژیکی و انگشت نگاری ژنتیکی
ب محصولات زراعی:
•    معرفي رقم جديد لوبيا قرمز (رقم ياقوت)
•    معرفی رقم جدید شبدر قرمز ( رقم نسیم)
•    معرفي رقم جديد لوبيا قرمز (رقم افق)
•    معرفی ارقام جدید لوبیا سفید شکوفا و درسا در لردگان
•    بررسی امکان کشت لوبیای لیما در لردگان
•    بررسي امكان كاشت ارقام لوبيا در كشت دوم در منطقه لردگان و خانمیرزا
•    بررسی امکان کشت و معرفی رقم مناسب کنجد در منطقه شهرکرد
•    معرفي رقم جديد سويا ( رقم پارسا)
•    بررسی عملکرد دانه ارقام تجاری نخود در کشت انتظاری و بهاره
•    مقایسه عملکرد ژنوتیپ های برتر کینوا در منطقه شهرکرد
 

مهمترین ماموریت های تحقیقات فنی و مهندسی
•    تعیین افزایش 27 درصدی عملکرد تر و 24 درصدی عملکرد خشک گیاهان علوفه¬ای ناشی از استفاده مجدد از خروجي تصفيه خانه فاضلاب (پساب) در آبياري اراضي 
•    تعیین میزان آب مورد نیاز بادام مامایی در مراحل مختلف رویشی با استفاده از سيستم آبياري قطره¬اي
•    تعیین میزان تاثير طرح تغذيه مصنوعي دشت سفيد دشت - فرادنبه بر كيفيت و كميت آب¬خوان منطقه بین 3/5 تا 3/7 میلیون مترمکعب در فاصله سال¬های 1382 تا 1385
•    شبیه¬سازی کمی آب¬های زیرزمینی حوضه جهانبین (دشت  شهرکرد) به منظور بهره¬برداری پایدار از آب¬خوان با استفاده از مدل MODFLOW
•    تعیین عوامل موثر در مدیریت آبیاری سیستم¬های آبیاری میکرو اجراء شده در باغات
•    تعیین اجزاء بيلان آبي تحت شرايط آبياري باراني و سطحي در زراعت يونجه
•    7- ارزيابي عملکرد ذرت علوفه‌اي در کشت نشايي و بذري و برآورد کارآيي مصرف آب در سه سيستم آبياري تيپ (نواري)‌، باراني و سطحي) 
•    بررسي تأثير سطوح آب آبياري بر عملکرد و کيفيت ميوه درختان هلو با استفاده از سيستم¬هاي آبياري قطره¬اي سطحي و زيرسطحي
 

مهمترین ماموریت های تحقیقات فنی و مهندسی
•    ارزیابی کارایی گاوداری¬های صنعتی استان
•    تعیین مزیت نسبی تولید بادام در استان
•    تعیین کارایی مزارع پرورش ماهی در استان
•    ارزیابی میزان مشارکت آبخیزنشینان در فعالیت¬های آبخیزداری
•    تعیین مزیت نسبی تولید هلو در استان
•    ارزیابی ساختار بازار بادام تولیدی استان
•    تعیین الگوی کشت مناسب در مناطقی از استان
 

اداره آموزش کارکنان
از ماموریت¬های اداره آموزش کارکنان می¬توان موارد زیر را برشمرد:
1.    افزايش توانايي حرفه¬اي بالفعل و پرورش توانايي¬هاي بالقوه كاركنان براي انجام وظايف و ماموريت¬هاي وزارت جهاد كشاورزي
2.    بهبود عملكرد فردي و گروهي كاركنان جهادکشاورزی در استان
3.    بهنگام سازي، توسعه و ارتقاء سطح دانش، بينش و مهارت¬هاي حرفه¬اي و تخصصي كاركنان
4.    آماده كردن كاركنان براي تصدي وظايف و مسئوليت¬هاي جديد و بالاتر و كمك به بهبود هرم منابع انساني وزارت
5.    آموزش به تناسب رشد و مسئوليت شغلي
6.    بهنگام سازي آموزش منابع انساني به منظور ايجاد زمينه¬هاي رشد خلاقيت و نوآوري در آنان
7.    ارائه روش¬هاي نوين آموزش كاركنان با توجه به تغييرات مفاهيم بنيادين آموزش در دنياي جديد
8.    تسهيل و تسریع در تحقق اهداف سازماني
9.    ايجاد زمينه هاي ارتقاء مدارج علمي و تخصصي كاركنان شاغل در بخش
10.    ايجاد بستر و يكسان نمودن استفاده از فرصت¬هاي آموزش براي كاركنان
اداره آموزش های کار و دانش، فنی و حرفه¬ای و کارورزان 
آموزش¬های رسمی شامل دانش¬آموزان کار دانش و فنی حرفه¬ای بوده که در قالب هنرستان¬های وابسته یا به صورت برون¬سپاری با هماهنگی اداره کل آموزش و پرورش استان صورت می¬پذیرد.
سنجش مهارت،؛ فراگیران بزرگسالی را شامل می¬شود که به لحاظ سنی قادر به ادامه تحصیل در دبیرستان¬های روزانه نبوده و به شیوه خوداظهاری موفق به اخذ گواهینامه مهارت حرفه¬ای کار و دانش کشاورزی می¬گردند.
براساس شیوه¬نامه تهیه شده و اظهارات داوطلبین با هر شرایط سنی مبنی بر میزان مهارت حرفه¬ای مطابق با استانداردهای مصوب کار و دانش کشاورزی، آزمون¬های مربوطه برگزار شده و به پذیرفته شدگان گواهینامه مهارت اعطاء خواهد شد. در سال¬های اخیر سنجش مهارت بالغ بر 1500 نفر در این اداره بر اساس استانداردهای اعلام شده انجام گردید.